Генные сети (архив)

Лекции (2019)

Название Ссылка на видео Презентации
Лекция №1. История становления понятия «Генные сети»: Концепция МГСУ
(лектор к.б.н. Игнатьева Е.В.)
Лекция №2. Генные сети
(лектор к.б.н. Игнатьева Е.В.)
Лекция №3. Часть 1. Генные сети. Часть 2. Генные сети в эпоху высокопроизводительного секвенирования
(лектор к.б.н. Игнатьева Е.В.)
Лекция №4. Часть 1. Генные сети в эпоху высокопроизводительного секвенирования. Часть 2. Базы данных по генным сетям.
(лектор к.б.н. Игнатьева Е.В.)
Лекция №5. Интеграция разрозненных источников информации по биомедицинской тематике
(лектор — м.н.с. лаб. компьютерной протеомики Тийс Е.)
Лекция №6. Реконструкция и анализ ассоциативных генных сетей
(лектор — м.н.с. лаб. компьютерной протеомики Тийс Е.)

Лекции (2017)

Название Ссылка на видео Презентации
Лекция №1. История становления понятия «Генные сети»: Концепция МГСУ
(лектор к.б.н. Игнатьева Е.В.)
Лекция №2. Генные сети
(лектор к.б.н. Игнатьева Е.В.)
Лекция №3. Часть 1. Генные сети. Часть 2. Генные сети в эпоху высокопроизводительного секвенирования
(лектор к.б.н. Игнатьева Е.В.)
Лекция №4. Часть 1. Генные сети в эпоху высокопроизводительного секвенирования. Часть 2. Базы данных по генным сетям.
(лектор к.б.н. Игнатьева Е.В.)
Лекция №5. Интеграция разрозненных источников информации по биомедицинской тематике
(лектор — к.б.н. Сайк О.В.)
Лекция №6. Реконструкция и анализ ассоциативных генных сетей
(лектор — к.б.н. Сайк О.В.)

Практические занятия

Название Ссылка для скачивания
Практическое занятие 1. Реконструкция сети белок-белковых взаимодействий для набора генов из базы KEGG с помощью программы GeneMANIA и последующий анализ программой Cytoscape.
Инструкции к практическому занятию 1. Часть 1
Инструкции к практическому занятию 1. Часть 2
Практическое занятие 2. Реконструкция сети белок-белковых взаимодействий для набора генов из базы KEGG с помощью программы STRING, их анализ в системе Cytoscape и сопоставление с данными, полученными из GeneMania
Инструкции к практическому занятию 2. Часть 1
Инструкции к практическому занятию 2. Часть 2
Инструкции к практическому занятию 2. Часть 3
Практическое занятие 3. Ознакомление с методами автоматического анализа текстов (text-mining). Анализ сверхпредставленных Gene Ontology биологических процессов ресурсом DAVID. Приоритезация генов-кандидатов ресурсами Endeavour, ToppGene
Практическое занятие 4. Компьютерная система ANDSystem. Реконструкция и анализ ассоциативных генных сетей. Выявление центральных вершин в генных сетях. Кластеризация генных сетей. Сравнение результатов реконструкции генных сетей различными системами.
Scroll to top