| Кураторы курса: | к.б.н. Богомолов А.Г., к.б.н. Комышев Е.Г. |
| Трудоемкость дисциплины: | 3 з.е. (108 ч) |
| Форма промежуточной аттестации: | экзамен |
| Программа дисциплины: | Скачать |
Курс условно можно разбить на две части. В первой части студенты получают базовые знания по методам цифровой обработки изображений биологических объектов. Во второй части курса студенты знакомятся с программой ImageJ и библиотекой OpenCV, с помощью которых можно решать задачи анализа изображений.
Литература
1. Гонсалес Р., Вудс Р. Цифровая обработка изображений. М.: Техносфера. 2012 – 1104 с.
2. Ильясова Н.Ю., Куприянов А.В., Храмов А.Г. Информационные технологии анализа изображений в задачах медицинской диагностики. М.: Радио и связь. 2012 – 424 с.
3. Красильников Н.Н. Цифровая обработка 2D- и 3D-изображений: учеб. пособие. СПб.: БХВ-Петербург, 2011. — 608 с.
4. Шапиро Л. Стокман Д. Компьютерное зрение. М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2006 – 752 с.
5. Яне Б. Цифровая обработка изображений. М.: Техносфера. 2007 – 584 с.
Перечень вопросов на экзамене
Вопрос 1. Основные понятия цифрового представления изображений
Вопрос 2. Основные стадии цифровой обработки изображений
Вопрос 3. Принципы формирования изображения в современных оптических микроскопах.
Вопрос 4. Фазово-контрастная микроскопия: принципы работы, теоретические основы получения изображения
Вопрос 5. Флуоресцентная микроскопия: принципы работы, теоретические основы получения изображения.
Вопрос 6. Теоретические основы получения изображения с помощью конфокальной микроскопии.
Вопрос 7. Цветовые модели изображения
Вопрос 8. Методы фильтрация изображений и их применение на изображениях биологических объектов.
Вопрос 9 Модель шумов. Подход к оценке шума.
Вопрос 10. Основные операции математической морфологии и их применение на изображениях биологических объектов.
Вопрос 11. Методы улучшения изображения и их применение на изображениях биологических объектов. Коррекция цвета на изображениях.
Вопрос 12. Подходы к сегментации изображений. Алгоритмы обнаружения объектов на изображении (точки, линии, округлые объекты).
Вопрос 13. Подходы к сегментации изображений. Метод водораздела.
Вопрос 14. Подходы к сегментации изображений. Пороговая сегментации.
Вопрос 15. Подходы к сегментации изображений. Наращивание областей.
Вопрос 16. Построение масок объектов. Связная компонента.
Вопрос 17. Характеристики объектов. Дескрипторы границ
Вопрос 18. Характеристики объектов. Дескрипторы областей: Текстура
Вопрос 19. Характеристики объектов. Дескрипторы областей: цвет
Вопрос 20. Характеристики объектов. Дескрипторы областей: геометрические характеристики
Вопрос 21. Построение серединной линии объекта. Выравнивание объектов.
Вопрос 22. Скелетизация объектов.
Вопрос 23. Арифметические операции над изображениями.
Вопрос 24. Классификация объектов. Нейронные сети
Вопрос 25. Классификация объектов. Статистические методы
Вопрос 26. Классификация объектов. Обучение по подобию
Вопрос 27. Способы визуализации данных, полученных в результате анализа биологических изображений