Итоговые задания.
1. Определить, какой белковой структуре соответствует последовательность
>test
hllqfrkmik kmtgkepvvs yafygcycgs ggrgkpkdat drccfvhdcc yekvtgcdpk
wddytyswkn gtivcggddp ckkevcecdk aaaicfrdnl ktykkrymay pdilcsskse
kc
2. Для данной структуры определить разметку вторичной структуры и долю поверхности остатков, доступную растворителю.
3. Найти последовательности гомологичных белков (по идентификатору PDB) 1PSJ:_, 1VIP:_, 1CL5:A, 1POC:_.
4. С помощью программы CLUSTAL выполнить множественное выравнивание тестовой последовательности и последовательностей указанных структур, и построить их филогенетическое дерево.
5. Выполнить структурное выравнивание тестовой структуры (цепи А) и 1POC:_ с помощью программы CE.
6. Для структуры тестового белка (цепь A) произвести поиск сайтов с помощью программы PDBSiteScan. Сохранить файл с наложенными сайтами на локальном диске.