Структурное выравнивание белков

Программа CE доступна на сайте  (http://cl.sdsc.edu/ce.html)
Провести выравнивание с помощью программы CE двух структур 4HHB:A (гемоглобин человека) и 1mba:_
(миоглобин миноги). Сохранить файл с выравниванием на локальном диске.
Сохранить файл с выровненными структурами  на локальный  компьютер и просмотреть
его  с помощью программы VewerLite.
Загрузить последовательности этих двух белков из выранивания (файл здесь). Провести их парное  выравнивание
с помощью программы blast2seq и CLUSTAL
Множественное выравнивание
CE multiple alignment
MASS
Системы классификаци  пространственных структур белков.
SCOP (http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/)
CATH (http://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath/)
Определить по этим  схемам структурную классификацию 1hb40;
1il8;  1ATP;

Scroll to top