36. Описание экспериментальных данных в базе данных ТРРД

Регуляторные районы генов имеют, как правило, большую длину — от тысяч до десятков тысяч пар оснований и содержат большое количество сайтов, повреждение каждого из которых может приводить к возникновению тяжелых патологий. При инициации транскрипции фермент РНК полимераза II, белки базального транскрипционного комплекса, а также различные транскрипционные факторы взаимодействуют с ДНК-сайтами, расположенными в регуляторном районе, и между собой. В результате формируется сложный ДНК-белковый комплекс, после чего начинается транскрипция гена.

Несмотря на разнообразие строения регуляторных районов, большинство их особенностей можно описать в рамках предложенной нами блочно-иерархической информационной модели. В ее рамках нижний уровень организации регуляторного района соответствует сайту связывания транскрипционного фактора. Одновременно работающие группы сайтов образуют регуляторные единицы иерархически более высоких уровней: композиционные элементы, энхансеры, сайленсеры и т.д. Они могут находиться на больших расстояниях от стартов транскрипции на 5′- и 3′-концах генов, а также в интронах. Высший уровень иерархии соответствует системе интегральной регуляции транскрипции.

БАЗА ДАННЫХ TRRD:

ОРГАНИЗАЦИЯ РЕГУЛЯТОРНЫХ РАЙОНОВ ГЕНА ЧЕЛОВЕКА, КОДИРУЮЩЕГО БЕЛОК АПОЛИПОПРОТЕИН В