Проведенные исследования показали, что эффективность связывания транскрипционных факторов с ДНК-сайтами определяется их конформационными особенностями, которые могут сильно меняться при мутациях. Например, сродство СRO-репрессора к своему оператору определяется шириной большой бороздки ДНК, сродство транскрипционного фактора USF к ДНК зависит от угла twist закрученности спирали ДНК. Сродство ТВР белка с сайтом его связывания определяется шириной малой бороздки и т.д.
МОДЕЛИРОВАНИЕ ВЛИЯНИЯ МУТАЦИЙ:
СРОДСТВО РЕГУЛЯТОРНЫХ БЕЛКОВ К САЙТАМ ИХ СВЯЗЫВАНИЯ ОПРЕДЕЛЯЕТСЯ КОНФОРМАЦИОННЫМИ СВОЙСТВАМИ ДНК