Экспериментально установлены зависимости от динуклеотидного контекста всех параметров, определяющих конформационные особенности спирали ДНК. Основываясь на свойствах конформационного кода, мы разработали компьютерные методы, позволяющие выявлять конформационные особенности ДНК-сайтов, значимые для взаимодействия с транскрипционными факторами, и исследовать влияние мутаций на активность сайтов.
МОДЕЛИРОВАНИЕ ВЛИЯНИЯ МУТАЦИЙ:
КОНФОРМАЦИОННЫЕ КОДЫ ДВОЙНОЙ СПИРАЛИ
Параметры, определяющие взаимную ориентацию оснований в пределах комплементарной пары и взаимное расположение соседних пар в спирали ДНК, кодируются в динуклеотидном коде