Модель генной сети описывается системой обыкновенных дифференциальных уравнений. Фрагмент модели биосинтеза холестерина представлен на рисунке. Она описывает 65 элементарных процессов, характеризующихся 93 константами. Примеры ряда констант приведены в нижней части рисунка.
БАЗА ДАННЫХ GENENET:
ФРАГМЕНТ СИСТЕМЫ ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНЫХ УРАВНЕНИЙ МАТЕМАТИЧЕСКОЙ МОДЕЛИ РЕГУЛЯЦИИ БИОСИНТЕЗА ХОЛЕСТЕРИНА В КЛЕТКЕ
Константы мономолекулярных реакций, с-1 | KISBfree = 1*10-02, Ksrpcdeg = 2.5*10-05, Kfre____ = 1*10-02, KLDLRdeg = 1.93*10-6, KsynLDL = 3.32*10-02, KutiLDL = 3.21*10-06, KdegLRin = 1.93*10-06 | |
Константы бимолекулярных реакций | л*ммоль-1*с-1 | с-1 |
Kclaw1 = 3.3*10-01 | Kclaw2 =1*10-03 | |
Константы ферментативных реакций | Константы оборота фермента, с-1 | Константы Михаэлиса, ммоль/л |
KISBestr = 1*10+02, KISBhydr = 1.9*10+03,KISBldlr = 1*10-1 | KMSBestr = 6.67*10-03, KMSBhydr = 7.6*10-01, KMSBldlr = 3.3*10-05 |